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NahR SAM AHL Integrase TetR Lux Pr Anderson - PowerPoint PPT Presentation

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  1. NahR ¡ SAM ¡ AHL ¡ Integrase ¡ ¡ ¡ TetR ¡ Lux ¡Pr ¡ Anderson ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡LuxI ¡ ¡ ¡ ¡ ¡LuxI ¡ ¡GFP ¡ RFP ¡ LuxR ¡ Gene8c ¡switch ¡

  2. Characterizing Genetic Switch pBad ¡

  3. Characterizing Genetic Switch

  4. Characterizing Genetic Switch

  5. Preliminary Signal Amplification Work

  6. The Biostake • In ground near water source • Easy for commercial or personal use

  7. The Biostake • Containment: • Semi-permeable membrane • Physical barrier to keep out debris • Polyvinyl alcohol hydrogel matrix (PVA) • Immobilizes bacterium • Allows diffusion of growth media • Diffusion of small molecule analytes • Slow influx of surrounding liquid • Pump/capillary action • Visual color change

  8. Interlab Measurement Study

  9. OUTREACH: CPI CONTAMINATION DISPUTE • Met with both sides to pitch our device to gather case-supporting evidence • Built cooperative implementation plan for sensor placement around Jefferson County, Colorado

  10. Meet eetup Even ent COLLABORATION Fracking Video Fr eo Pr Proj ojec ect Survey eys Pr Proj ojec ect Mot otivation on

  11. THANK YOU

  12. Naphthalene Concentrations and Health Risks • Natural ¡Concentra8on: ¡ • <0.01 ¡ppb ¡in ¡rural ¡regions ¡(where ¡drill ¡sites ¡are ¡located) ¡ • 0.16 ¡ppm ¡ppb ¡in ¡urban ¡areas ¡ • World ¡Health ¡Organiza8on ¡(WHO): ¡ • 0.188 ¡ppm ¡maximum ¡concentra8on ¡ • Environmental ¡Protec8on ¡Agency ¡ • ~0.001 ¡ ¡ • Lethal ¡dose: ¡ • 650 ¡ppm ¡ • Causes ¡hemoly8c ¡anemia ¡and ¡nerve ¡damage ¡with ¡prolonged ¡exposure ¡

  13. NahR Transcriptional Regulator • From ¡Peking ¡2013 ¡iGEM ¡team ¡ • Sensi8vity ¡ • Can ¡detect ¡0.1-­‑3 ¡µg/L ¡of ¡naphthalene ¡deriva8ves ¡(versus ¡EPA’s ¡0.001 ¡µg/L ¡ regula8on) ¡ • Supplied ¡in ¡iGEM ¡Distribu8on ¡Kit ¡ • Comprised ¡of ¡4 ¡separate ¡genes ¡for ¡degrada8on ¡of ¡naphthalene ¡ deriva8ves ¡into ¡salicylate ¡to ¡act ¡upon ¡an ¡inducible ¡promot34 ¡

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