NahR ¡ SAM ¡ AHL ¡ Integrase ¡ ¡ ¡ TetR ¡ Lux ¡Pr ¡ Anderson ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡LuxI ¡ ¡ ¡ ¡ ¡LuxI ¡ ¡GFP ¡ RFP ¡ LuxR ¡ Gene8c ¡switch ¡
Characterizing Genetic Switch pBad ¡
Characterizing Genetic Switch
Characterizing Genetic Switch
Preliminary Signal Amplification Work
The Biostake • In ground near water source • Easy for commercial or personal use
The Biostake • Containment: • Semi-permeable membrane • Physical barrier to keep out debris • Polyvinyl alcohol hydrogel matrix (PVA) • Immobilizes bacterium • Allows diffusion of growth media • Diffusion of small molecule analytes • Slow influx of surrounding liquid • Pump/capillary action • Visual color change
Interlab Measurement Study
OUTREACH: CPI CONTAMINATION DISPUTE • Met with both sides to pitch our device to gather case-supporting evidence • Built cooperative implementation plan for sensor placement around Jefferson County, Colorado
Meet eetup Even ent COLLABORATION Fracking Video Fr eo Pr Proj ojec ect Survey eys Pr Proj ojec ect Mot otivation on
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Naphthalene Concentrations and Health Risks • Natural ¡Concentra8on: ¡ • <0.01 ¡ppb ¡in ¡rural ¡regions ¡(where ¡drill ¡sites ¡are ¡located) ¡ • 0.16 ¡ppm ¡ppb ¡in ¡urban ¡areas ¡ • World ¡Health ¡Organiza8on ¡(WHO): ¡ • 0.188 ¡ppm ¡maximum ¡concentra8on ¡ • Environmental ¡Protec8on ¡Agency ¡ • ~0.001 ¡ ¡ • Lethal ¡dose: ¡ • 650 ¡ppm ¡ • Causes ¡hemoly8c ¡anemia ¡and ¡nerve ¡damage ¡with ¡prolonged ¡exposure ¡
NahR Transcriptional Regulator • From ¡Peking ¡2013 ¡iGEM ¡team ¡ • Sensi8vity ¡ • Can ¡detect ¡0.1-‑3 ¡µg/L ¡of ¡naphthalene ¡deriva8ves ¡(versus ¡EPA’s ¡0.001 ¡µg/L ¡ regula8on) ¡ • Supplied ¡in ¡iGEM ¡Distribu8on ¡Kit ¡ • Comprised ¡of ¡4 ¡separate ¡genes ¡for ¡degrada8on ¡of ¡naphthalene ¡ deriva8ves ¡into ¡salicylate ¡to ¡act ¡upon ¡an ¡inducible ¡promot34 ¡
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