BUCT-China iGEM 2014 TOXINMETER iGEM 2014 Diseases My name - PowerPoint PPT Presentation

BUCT-China iGEM 2014 �

TOXINMETER iGEM 2014 �

Diseases ¡ My ¡name ¡is ¡ ¡ Hello � e.g. ¡ Detec3on � Minamata ¡disease ¡

Normal ¡methods ¡ ¡to ¡detect ¡the ¡water ¡quality � Gas Chromatograph � Too ¡complicated � Spectrophotometer �

The ¡heavy ¡equipment ¡makes ¡ me ¡uncomfortable � e.g. ¡ 2013 ¡ITB-­‑Indonesia ¡iGEM ¡ 2011 ¡LMU-­‑Munich ¡iGEM ¡

Is the water safe? Can we drink it? �

river � BUCT-CHINA DEVICE �

Comprehensive ¡ toxin ¡detecKon � Specific ¡ detecKon �

Comprehensive ¡detecKon ¡ � luxA � luxB � mRNA � toxin � luciferase � RCHO � FMN+NAD(P)H ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡FMNH2+NAD(P) ¡ FMNH2+RCHO+O2 ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡ ¡FMN+RCOOH+H2O+ hv � fluorescence � fluorescence �

How do we detect specific ions ? �

¡MerR ¡ ¡family � Hg � Hg (II) � MerT � MerP � MerA � NADPH � NADP � Hg (II) � RNAP � MerR � PmerT � T � P � A � D � MerR ¡ dimer �

Specific ¡detecKon ¡ � AHL � luxR � luxR � luxI � GFP � luxR � luxI � MerR � pMerT � gfp � plac � pRlux � Hg (II) �

I ¡can ¡hardly ¡breath, ¡it’s ¡too ¡ narrow… �

chips � Bioluminescence � Collec3ng ¡lights � Opera3onal ¡amplifier � Second-­‑order ¡ac3ve ¡low-­‑pass ¡ filter � detecKon � Analog ¡digital ¡conversion � Single ¡Chip ¡Microcomputer �

Parts  Quorum sensing  Hg(II) sensor  Composite part

The ¡results ¡of ¡gel ¡electrophoresis � J09855 � K081008 � 2KB � 1KB � Plac � RBS � luxR � luxPR � RBS � LuxI �

The ¡results ¡of ¡gel ¡electrophoresis � 2KB � K346002 � E0240 � Synthesized � 1KB � merR � PmerT � GFP �

The ¡results ¡of ¡gel ¡electrophoresis � 5.1Kb � K1513000 � K1513002 � PmerT � LuxI � merR � Plac � RBS � luxR � luxPR � RBS � GFP �

Device ¡test � 1ng/ml �

Practice  Pass on  Team communication  ISSB  Sample �

Pass ¡on �

Team communication

ISSB �

Sample �

Participation  Attribution  Acknowledgement

A[ribuKons �

Acknowledgement �

Participation  Completion

Q ¡& ¡A �