revisi2ng wavelet compression for large scale climate
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Revisi2ng Wavelet Compression for Large-Scale Climate Data - PowerPoint PPT Presentation

Revisi2ng Wavelet Compression for Large-Scale Climate Data using JPEG 2000 and Ensuring Data Precision John PatcheK (patcheK@lanl.gov) Presenter October


  1. Revisi2ng ¡Wavelet ¡Compression ¡for ¡ Large-­‑Scale ¡Climate ¡Data ¡using ¡JPEG ¡ 2000 ¡and ¡Ensuring ¡Data ¡Precision ¡ John ¡PatcheK ¡(patcheK@lanl.gov) ¡Presenter ¡ ¡ October ¡24, ¡2011 ¡ ¡ Jonathan ¡Woodring ¡(woodring@lanl.gov) ¡ Susan ¡Mniszewski ¡(smm@lanl.gov) ¡ Christopher ¡Brislawn ¡(brislawn@lanl.gov) ¡ David ¡DeMarle ¡(dave.demarle@kitware.com) ¡ James ¡Ahrens ¡(ahrens@lanl.gov) ¡ ¡ Operated ¡by ¡Los ¡Alamos ¡Na2onal ¡Security, ¡LLC ¡for ¡the ¡U.S. ¡Department ¡of ¡Energy’s ¡NNSA ¡

  2. Introduc2on: ¡Use ¡Case ¡ • Los ¡Alamos ¡scien2st ¡ ¡(New ¡Mexico) ¡ – Computa2onal ¡Ocean ¡Modeler ¡ ¡ • Data ¡at ¡Oak ¡Ridge ¡(Tennessee) ¡ – Parallel ¡Ocean ¡Program ¡(POP) ¡ – 3600x2400x42 ¡structured ¡grid ¡ ¡ – Typically ¡wants ¡scalar ¡fields ¡(temp, ¡salt, ¡u, ¡v) ¡ • Limited ¡Bandwidth ¡(1MB/s) ¡ – We ¡don’t ¡control ¡arbitrary ¡endpoints ¡ – Bandwidth ¡issues ¡for ¡various ¡situa2ons ¡that ¡are ¡ beyond ¡our ¡control. ¡ Operated ¡by ¡Los ¡Alamos ¡Na2onal ¡Security, ¡LLC ¡for ¡the ¡U.S. ¡Department ¡of ¡Energy’s ¡NNSA ¡

  3. Related ¡Work ¡ • Large ¡Data ¡ ¡ – Creates ¡data ¡movement ¡issues ¡ • Distance ¡Visualiza2on ¡ – Has ¡bandwidth ¡limited ¡channels ¡exacerba2ng ¡data ¡ movement ¡problems ¡ • In ¡situ ¡analysis ¡ – A ¡response ¡to ¡data ¡movement ¡ • Compression ¡ – AKempt ¡to ¡have ¡less ¡data ¡movement ¡ Operated ¡by ¡Los ¡Alamos ¡Na2onal ¡Security, ¡LLC ¡for ¡the ¡U.S. ¡Department ¡of ¡Energy’s ¡NNSA ¡

  4. Related ¡Work: ¡Data ¡Compression ¡ • Wavelets ¡have ¡been ¡used ¡extensively ¡for ¡data ¡ reduc2on ¡and ¡mul2scale ¡visualiza2on ¡ • Non-­‑wavelet ¡techniques ¡have ¡been ¡developed ¡ by ¡vis ¡community ¡for ¡compression, ¡ quan2za2on, ¡and ¡mul2resolu2on ¡ ¡ • We ¡leverage ¡the ¡signal ¡processing ¡and ¡data ¡ compression ¡communi2es ¡by ¡using ¡JPEG ¡2000 ¡ Operated ¡by ¡Los ¡Alamos ¡Na2onal ¡Security, ¡LLC ¡for ¡the ¡U.S. ¡Department ¡of ¡Energy’s ¡NNSA ¡

  5. Related ¡Work: ¡Wavelets ¡ J. ¡Clyne, ¡P. ¡Mininni, ¡A. ¡Norton, ¡and ¡M. ¡Rast. ¡Interac2ve ¡desktop ¡analysis ¡of ¡high ¡resolu2on ¡simula2ons: ¡Applica2on ¡ • to ¡turbulent ¡plume ¡dynamics ¡and ¡current ¡sheet ¡forma2on. ¡ New ¡Journal ¡of ¡Physics , ¡9(8):301–301, ¡2007. ¡ S. ¡Muraki. ¡Approxima2on ¡and ¡rendering ¡of ¡volume ¡data ¡using ¡wavelet ¡transforms. ¡ Proceedings ¡of ¡the ¡3rd ¡ • conference ¡on ¡Visualiza9on ¡’92 , ¡pages ¡21–28, ¡1992. ¡ACM ¡ID: ¡949694. ¡ J. ¡Woodring ¡and ¡H. ¡Shen. ¡Mul2scale ¡2me ¡ac2vity ¡data ¡explora2on ¡via ¡temporal ¡clustering ¡visualiza2on ¡ • spreadsheet. ¡ IEEE ¡Transac9ons ¡on ¡Visualiza9on ¡and ¡Computer ¡Graphics , ¡15(1):123–137, ¡2009. ¡ Z. ¡Zhu, ¡R. ¡Machiraju, ¡B. ¡Fry, ¡and ¡R. ¡Moorhead. ¡Wavelet-­‑based ¡mul2resolu2onal ¡representa2on ¡of ¡computa2onal ¡ • field ¡simula2on ¡datasets. ¡In ¡ Visualiza9on ¡’97., ¡Proceedings , ¡pages ¡151–158. ¡IEEE, ¡Oct. ¡1997. ¡ S. ¡Guthe, ¡M. ¡Wand, ¡J. ¡Gonser, ¡and ¡W. ¡Strasser. ¡Interac2ve ¡rendering ¡of ¡large ¡volume ¡data ¡sets. ¡In ¡ Visualiza9on ¡ • Conference, ¡IEEE , ¡pages ¡50–60, ¡Los ¡Alamitos, ¡CA, ¡USA, ¡2002. ¡IEEE ¡Computer ¡Society. ¡ I. ¡Ihm ¡and ¡S. ¡Park. ¡Wavelet-­‑based ¡3D ¡compression ¡scheme ¡for ¡very ¡large ¡volume ¡data. ¡In ¡ Graphics ¡Interface , ¡pages ¡ • 107–116, ¡1998. ¡ T. ¡Kim ¡and ¡Y. ¡Shin. ¡An ¡efficient ¡wavelet-­‑based ¡compression ¡method ¡for ¡volume ¡rendering. ¡In ¡ Computer ¡Graphics ¡ • and ¡Applica9ons, ¡1999. ¡Proceedings. ¡Seventh ¡Pacific ¡Conference ¡on , ¡pages ¡147–156, ¡1999. ¡ F. ¡Rodler. ¡Wavelet ¡based ¡3D ¡compression ¡with ¡fast ¡random ¡access ¡for ¡very ¡large ¡volume ¡data. ¡In ¡ Computer ¡ • Graphics ¡and ¡Applica9ons, ¡1999. ¡Proceedings. ¡Seventh ¡Pacific ¡Conference ¡on , ¡pages ¡108–117, ¡1999. ¡ A. ¡TroK, ¡R. ¡Moorhead, ¡and ¡J. ¡McGinley. ¡Wavelets ¡applied ¡to ¡lossless ¡compression ¡and ¡progressive ¡transmission ¡of ¡ • floa2ng ¡point ¡data ¡in ¡3-­‑D ¡curvilinear ¡grids. ¡In ¡ Visualiza9on ¡’96. ¡Proceedings. , ¡pages ¡385–388. ¡IEEE, ¡Nov. ¡1996. ¡ C. ¡Wang, ¡J. ¡Gao, ¡L. ¡Li, ¡and ¡H. ¡Shen. ¡A ¡mul2resolu2on ¡volume ¡rendering ¡framework ¡for ¡Large-­‑Scale ¡Time-­‑Varying ¡ • data ¡visualiza2on. ¡In ¡ Volume ¡Graphics, ¡2005. ¡Fourth ¡Interna9onal ¡Workshop ¡on , ¡pages ¡11–223, ¡2005. ¡ R. ¡Westermann. ¡A ¡mul2resolu2on ¡framework ¡for ¡volume ¡rendering. ¡ Proceedings ¡of ¡the ¡1994 ¡symposium ¡on ¡ • Volume ¡visualiza9on , ¡page ¡51–58, ¡1994. ¡ACM ¡ID: ¡197963. ¡ Operated ¡by ¡Los ¡Alamos ¡Na2onal ¡Security, ¡LLC ¡for ¡the ¡U.S. ¡Department ¡of ¡Energy’s ¡NNSA ¡

  6. Related Work: Send Geometry Interac2ve ¡Rendering ¡ Geometry/ Simula2on ¡ of ¡Images ¡ Triangles ¡ Results ¡ Applica2on ¡ Visualiza2on ¡ ¡Image ¡ Rendering ¡ Simula2on ¡ Algorithms ¡ Display ¡ Graphics ¡ Supercomputer ¡ ¡Display ¡ Cluster ¡ Operated ¡by ¡Los ¡Alamos ¡Na2onal ¡Security, ¡LLC ¡for ¡the ¡U.S. ¡Department ¡of ¡Energy’s ¡NNSA ¡

  7. Related Work: Send Imagery Interac2ve ¡Rendering ¡ Geometry/ Simula2on ¡ of ¡Images ¡ Triangles ¡ Results ¡ Applica2on ¡ Visualiza2on ¡ ¡Image ¡ Rendering ¡ Simula2on ¡ Algorithms ¡ Display ¡ Graphics ¡ Cluster ¡ Supercomputer ¡ ¡ Display ¡ Operated ¡by ¡Los ¡Alamos ¡Na2onal ¡Security, ¡LLC ¡for ¡the ¡U.S. ¡Department ¡of ¡Energy’s ¡NNSA ¡

  8. Our Approach: Send Data Interac2ve ¡Rendering ¡ Geometry/ Simula2on ¡ of ¡Images ¡ Triangles ¡ Results ¡ Applica2on ¡ Visualiza2on ¡ ¡Image ¡ Rendering ¡ Simula2on ¡ Algorithms ¡ Display ¡ Graphics ¡Cluster ¡ ¡Display ¡ Supercomputer ¡ Operated ¡by ¡Los ¡Alamos ¡Na2onal ¡Security, ¡LLC ¡for ¡the ¡U.S. ¡Department ¡of ¡Energy’s ¡NNSA ¡

  9. Our ¡Approach: ¡Data ¡Compression ¡with ¡ Quan2fied ¡Accuracy ¡ ¡ ¡ • In ¡visualiza2on ¡and ¡image ¡processing, ¡data ¡compression ¡ and ¡the ¡resul2ng ¡error ¡has ¡been ¡measured ¡as ¡average ¡ difference ¡ – concerned ¡with ¡reducing ¡visual ¡quality ¡differences ¡ • Compression ¡directly ¡in-­‑situ ¡on ¡simula2on ¡data ¡as ¡a ¡data ¡ reduc2on ¡mechanism ¡ – our ¡research ¡focus ¡is ¡to ¡quan2fy ¡the ¡maximum/L-­‑infinity ¡norm ¡ (rather ¡than ¡average/L2 ¡norm) ¡data ¡quality ¡for ¡scien2fic ¡analysis ¡ – Provide ¡a ¡solu2on ¡that ¡automa2cally ¡compresses ¡simula2on ¡ data ¡with ¡accuracy ¡guarantees ¡ • (Simula2on ¡Data ¡– ¡Compressed ¡Representa2on) ¡provides ¡ an ¡accuracy ¡metric ¡ Operated ¡by ¡Los ¡Alamos ¡Na2onal ¡Security, ¡LLC ¡for ¡the ¡U.S. ¡Department ¡of ¡Energy’s ¡NNSA ¡

  10. Our ¡Approach: ¡Compression-­‑ ¡ Decompression ¡Pipeline ¡ Original Floating Point Data Masking Quantization Compression (Global Average) (PCM) (JPEG2000) Network Decompression Dequantization UnMasking (JPEG2000) (PCM) Reconstructed Floating Operated ¡by ¡Los ¡Alamos ¡Na2onal ¡Security, ¡LLC ¡for ¡the ¡U.S. ¡Department ¡of ¡Energy’s ¡NNSA ¡ Point Data

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